一、水系－全州境内河流纵横，有主要河流23条、5个高原湖泊，分属珠江（南盘江）和红河两大水系；龙潭291处（出水量在10升/秒）。全州水资源量223亿立方米；其中地表水资源量148亿立方米，地下水资源量75亿立方米。一是河流分南盘江水系和红河水系。1、南盘江发源曲靖市沾益马雄山，在弥勒县西二乡的万糯村入红河州，干流长282公里，径流面积12936平方公里。支流4条曲江、泸江、甸溪河、小江；2、红河发源于大理巍山先珠街，在元江县红河县界与南昏河汇口处入红河州；自西北向东经红河县、石屏县、元阳县、建水县、个旧市、金平县、蒙自县入河口县，由河口镇东南进入越南。干流长240公里，高差251米，集水面积11496平方公里（不含李仙江和藤条江）。境内主要支流有17条河流－小河底、木龙河（七星河）、排沙河（南沙河）、龙岔河、贾沙河、普洒河、卡房冲河、逢春岭河、麻子河、绿水河、大寨河、马卡依河、老碑邑河、新现河、新桥河、龙博河、南溪河；3、藤条江发源于红河县牛威乡；经红河县洛恩、绿春县戈奎、元阳县黄茅岭至金平县那发出境入越南。州内河长173公里，集水面积4200平方公里，高差1460米，主要支流有6条－乌拉河、茨通坝河、荞菜坪河、金子河、金河、金水河。4、李仙江发源于大理南涧宝华，在红河州内长83公里，高差为159米，集水面积3325平方公里。主要支流3条小黑江、月牙河、牛孔河。二是湖泊主要有：异龙湖位于石屏县，湖长15.5公里，南北宽3.5公里，最大水深9米，湖水面积53平方公里，容量2.28亿立方米；赤瑞湖湖水面积0.5平方公里，容量52.2万立方米；长桥海集水面积167平方公里容量4000万立方米；大屯海径流面积284.5平方公里；容量3000万立方米；三角海径流面积131平方公里，容量2700万立方米；无浪海径流面积16.7平方公里，容量450万平方米；金湖年蓄水量400万立方米。三是龙潭，其中温泉72处，低温泉23℃－24℃的48处，中温泉40℃－60℃的13处，高温泉60℃－103℃的11处，流量最大的是元阳糖厂温泉，为417.09升/秒。水温最高的是金平马磨索大热水塘，达103℃，流量0.35升/秒。

　　二、土壤－全州分布丰富的土壤种类，有铁铝土、淋溶土、半淋溶土、初土、半水成土、人为水成土6个土纲，砖红壤、赤红壤等13个土类，22个亚类，46个土属，88个土种（其中水稻土24个、旱作土64个）。土壤面积4239.77万亩（自然土3632.66万亩、耕作土607.11万亩）。全州面积最大、分布最广的铝土纲有砖红壤、赤红壤、红壤、黄壤4个土类；面积达3155.1万亩（自然土2831.63万亩、旱作土323.47万亩），占土壤面积的74.42％。州内土壤具有水平地带性、垂直地带性和区域性的分布规律，并以垂直分布最为突出。由于生物气候影响，地带性土壤多沿等高线呈带谱状分布。主要分布情况为：海拨900米以下有砖红壤，海拨800米－1400米有赤红壤，海拨1350米以上有红色壤，海拨1000米－1900米有黄壤，海拨1800米－2500米有黄棕壤，海拨2500米－3000米有棕壤。南北、东西、迎风、背风都有差异。